Пока использую Borland TeamSource, в общем, в пределах локальной сети всем устараивает, но в последнее время приходится вести общий проект на несколько организаций.
Пытались организовать архив TeamSource на ftp, однако он программа не может корректно к нему обратится.
Вообще возможно ли это с помощью TeamSource?

Попробуйте использовать утилиту webdrive (http://www.southrivertech.com/products/webdrive/index.html). Этот утиль позволяет отображать FTP ресурс как локальный диск.