Планируем заказать сабж, но есть вопрос по покрытию подложки. Фирмы-изготовители говорят что они подложку ничем не покрывают. Т.е. со временем алюминий будет окисляться, что приведет к плохому контакту с корпусом , к которому плата крепится. Есть ли у кого-нибудь опыт работы с такими платами, как можно решить проблему покрытия подложки после изготовления платы?

Промажьте места контакта платы с корпусом пастой Суперконт.

Вам нужен тепловой или электрический контакт?

Как вариант - платы на медной подложке с покрытием иммерсионным золотом.

Нужен и тот и другой

На зарубежном производстве для алюминиевой подложки возможны два варианта покрытия - светлое оксидирование (наш аналог называется "Хим.Окс." ГОСТ9.306-85) и покрытие типа "чернение" (анодное оксидирование или "Ан.Окс.").
Но может быть и третий вариант - вообще без покрытия - если позволяют условия эксплуатации печатной платы в составе изделия.

Ну про тепловой беспокоиться не стоит, толшина оксидного слоя несколько микрон, так что там потери будут не существенны, в десятки (может и сотни) раз меньше чем на пасте. С электрическим посложнее, всё завист от способа крепления, вообще сопротивление оксидного слоя известно, зная ток можно прикинуть сколько упадёт на переходе.