Пытаюсь разобраться с IAR для ARM (контроллер OKI ML67q5003). Каким образом можно залить код во flash контроллера, если flashloader'а в IAR для него нет?

Написать свой Flashloader, делается довольно просто - обычно достаточно написать функцию записи байта во flash. Примеры и Framework есть в комплекте.