Моделирую транзистроный ключ (схема с общим эмиттером). При во всех режимах близких к граничным по быстродействию модель нисколько не адекватна работе реальной схемы. Может кто-нибудь с этим сталкивался? По идее модель Гуммеля-Пуна должна давать достаточно точное совпадение результатов.

Приведите модель схемы, файл симуляции. Укажите какие параметры Вас не устроили.
что за симулятор , их теперь море.