Много гуглил на тему модульного тестирования в avr studio, ничего внятного не нашёл
Кто-нибудь использует? какой фреймворк? как прикрутить к студии? контроллер - атмега128. Тестировать хотелось бы на компьютере.

А что это такое - модульное тестирование? Что тестировать и зачем?

http://ru.wikipedia.org/wiki/Модульное_тестирование

Т.е. цель - создание тестов, проверяющих правильность программы, чтобы повысить её качество.

Поскольку симуляция периферии в AVRstudio изобилует багами, которые никто упорно не собирается исправлять, предлагаю на это забить и тестировать только машинно-независимый уровень уже имеющимися средствами. Например, GCC - он и в Африке Гцц. Только придерживаться стандартных типов в stdint.h

что такое фреймворк?

Присоединяюсь к _Pasha - разделите железо и логику, логику тестируйте на компьютере. Лично я использовал самописный каркас по мотивам Кента Бека, сейчас потихоньку перемещаюсь на http://code.google.com/p/googletest