На сайте Атмела предлагается в качестве отладчика использовать либо AVR Dragon, либо AVR JTAGICE mkII. Но Dragon работает с флеш до 32кБ. Т.е. остается только mkII. Есть ли другие варианты? В идеале нужно использовать с CodeVision, но прочитал, что данный софт не знает про mkII.

Нет.

Вычитал здесь

"It also include full emulation support for devices with 32kB or less Flash memory."

А вот здесь таблица совместимости

Устаревшая информация. Читаем документацию к свежим AVR Studio. И поиск по форуму работает http://electronix.ru/forum/index.php?showt...Dragon&st=0

Спасибо. А не в курсе, есть ли поддержка Dragon`а в CodeVision?

Вы, зачем-то собрались его использовать - Вам виднее Возьмите документацию и поиском за несколько секунд найдете ответ.
http://www.hpinfotech.ro/html/cvavr_doc.htm