GPS модуль EB500, ухудшается прием при работающем процессоре.
Питание у них общее, от 3.3в, процессор PXA270 работает на частоте 520мгц
Если процессор находится в спящем режиме, прием на 20-30 процентов лучше, и спутники
модуль находит на много быстрее
может наводки по питанию идут?

может наводки по питанию идут? ну так проверь...
и само питание проверь. может антенне маловато приходит...

с напругой все нормально, 3,3в, на внешнюю антенну 2.8в
вот питание фонит, на модуль GPS питание идет через ферритовый дроссель
может что еще добавить?

сплеттер от такторой процессора забивает чуствительность приемника, особенно третья гармоника близка к приемному каналу GPS.
продуманная экранировка и "чистка" питания на внешнюю антенну поможет.