Нужно сделать устройство с USB Mass Storage с использованием SD, MMC и с передачей данных в МК (UART, SPI). Смотрел в инете, варианты есть, например AT90USB и ещё… Но все варианты какие-то многоножные, «крупногабаритные». Есть варианты попроще, лучше с аппаратной реализацией, но и достаточно распространённые?

Смотрите в сторону Cypress.