Здравствуйте!
Вопрос - возможно ли поменять слои местами после того как проведена трассировка?

Это зависит от пакета, в котором вы работаете.
В ПАДСе - легко, переназначение слоев возможно в любой момент.
В каком пакете выполнен ваш проект ?

Один вопрос - а зачем Вам их менять местами? На уровне РСВ-файла это все равно абстрактная информация. При задании на производство генерятся отдельные файлы слоев, главное правильно указать порядок их следования в сопроводительной документации. Единственная задача, где это реально имеет значение - это моделирование целостности сигналов.

Простите, не указала. Работаю в P-CAD2006.
Плата шестислойная и на ней присутствуют внутренние глухие переходные отверстия, поэтому для их правильного использования, чтоб ничего не напутать, нужен строго упорядоченный стек.

Аааа... Тогда у Вас проблемы. Просто поменять можно только слои уже связанные соответствующими переходными. При более глобальных изменениях придется переделывать.

Нужно поменять местами внутренние слои.
на данный момент стек имеет вид:
-Top
-sig1
-sig2
-power
-gnd
-Bottom

sig2 и gnd желательно поменять местами дабы стек был симметричен. Слои разведены и на них присутствуют сквозные переходные. Переделывать? Или же такая абстрактная информация не принципиальна при производстве?

Если на них только сквозные, меняйте как хотите. А вот если у Вас есть переходные Bottom-GND и GND-Sig1 то уже ничего не получится, только переделывать...