Здравствуйте.

Имеется в наличии плата SK-MAT91SAM9260 и MT-Link. на борту платы есть внешняя флэш AT45DB321.
Подскажите каким образом и чем (интересуют как программные так и аппаратные средства) заливать программу в AT45DB321.

Сначала самбой заливаем в рам свою программу, которой уже и пишем что хотим и куда хотим.
У самбы также есть готовые модули для этих целей (в смысле, для заливки программ, которые уже на вторичной основе пишут в датафлэш, инициализируют SDRAM, pll и прочая).

Но мой совет - написать это самостоятельно. Сэкономите массу времени.

А нафига мне MT-Link тогда? мне нужно чтобы прграмма лежала во флеши и при запуске оттудова извлекалась и выполнялась

И все это спокойно делается при помощи SAM-BA. Через UART, USB или JTAG по вкусу.

Ну расскажите хотябы мельком как и чем (программа какая) это сделать через MT-Link.

Почитать и скачать можно здесь.