Существует вполне рабочий проект на связке atmega128L и at45db161d по аппаратному spi. Всё бы ничего, но 128-е и 128L снимают с производства и взамен предлагают atmega128a. Миграции практически никакой в даташите не приведено, пишут про полную программную совместимость.
А на деле следующее:
atmega128a и at45db161d соединены проводниками по аппаратному spi (других spi устройств на шине нет), запитаны от одного источника напряжением 2, 97 В. Связи нет. При замене на той же плате процесора на atmega128L с тем же кодом на борту- всё работает. Что бы это могло быть?

Большинство экстрасенсов сейчас в отпуске Можно подробнее? В смысле на какие нибудь команды DataFlash() отвечает или вообще молчит. Или тупо заменили и не работает и только "чеделатьчедалеть "

Извините за малость фактов.
Есть 20 одинаковых плат. На нах стоят 20 процов 128А
Все команды с памятью выполняют только 2 из 20. Т.е. на лицо некая статистика. Как я уже говорил, при замене на неработающей плате процессора с 128a на 128L всё волшебным образом начинает работать. Выполняются команды очистки, записи и чтения.
Напротив, до замены все эти команды выполняются как-то странно. Очистка - работает. Запись не работает либо работает недолгое время (несколько секунд от начала алгоритма) и чтение - почти не работает (удалось поймать 1 раз за сим процессом).
Частота spi довольна низка - 250 кГц.
Даже задержки в 12 мкс вводил после активации пина выбора кристалла памяти - думал, фронт не успевает. Не помогло.

Даташиты сравнивали?

Да. Разницы не увидел.
Есть разница по напряжениям логического 0 на портах, увеличился на 0,1 В, копаю в эту сторону. Возможно, не хватает для включения кристалла памяти. Хотя врядли, в плече делителя на ноге CS памяти стоит резистор 10к на питание.

Копаете правильно Только вот не понятно с последним Вашим предложением. Чтобы кристалл включился, нужно ноль на CS подать, а Вы чего то про подтяжку к питанию говорите... Кстати, на входе MISO МК внутренний пулл-ап включен? А то может быть флэшка и отвечает, а МК понять не может. Вообще, для вылавливания таких глюков нуна осциллоскоп иметь.

А я это делал по аналогии с аппноутом AVR335, там CS подтянули к питанию, а выбор кристалла осуществляют переводом ноги МК, также подключенного к CS, в 0... В принципе, резистор и не нужен, но для души спокойнее, что в случае перезагрузки МК кристалл памяти не активизируется и мусора не понабирает.

Да.

Работаем в этом направлении
Вообще бесит, что кристаллы "де юре" заменяемы, а "де факто" нет

А дно заземлили ? У "А", наскольо я помню, требуется дно землить.

Корпус TQFP -пластиковый. Нечего заземлять на данном типе

Сегодня выкинул резистор, о котором шла речь ранее - ничего не изменилось

Ну а осциллографом то смотрели? Что приходит на флэшку, что от нее уходит? Если нет осциллографа , попробуйте простым светодиодом. Определитесь хотя бы, в какой стороне проблема.

Ну, раз работает, но недолго, то значит, вы находились на границе допусков и после прогрева кристалла, когда параметры уплывают, вы выходите за границу. В SPI установках обратите внимание на фазу клока и полярность по отношению к данным, должно помочь.

Благодарю всех за помощь. Проблема решилась.
Всё было банальнее - логическая ошибка в алгоритме на более высоком уровне, нежели уровень записи во флеш

Все работает!