Вот пример:
Ноги в файле 6slx150fgg676pkg.txt
CODE
Device/Package 6slx150fgg676 Wed Mar 31 17:26:17 2010
Pin Bank BUFIO2 Pin Description
A24 NA NA TDO
M11 NA NA VCCINT
P7 3 LT IO_L45P_M3A3_3
Pin Bank BUFIO2 Pin Description
A24 NA NA TDO
M11 NA NA VCCINT
P7 3 LT IO_L45P_M3A3_3
Ноги в файле Spartan-6 FPGA Packaging UG385 (v1.3) October 12, 2010
CODE
Table 2-14: FG(G)676 Package—LX75, LX100, and LX150
Bank Pin Description Pin Number BUFIO2 Region No Connect (NC)
NA TDO A24 NA
NA VCCINT M11 NA
NA GND P7 NA
Bank Pin Description Pin Number BUFIO2 Region No Connect (NC)
NA TDO A24 NA
NA VCCINT M11 NA
NA GND P7 NA
Я привел только часть несоответствий, на самом деле их гораздо больше. Особенно радует ножка M11 в одном месте она GND, а в другом VCCINT

Проверял только для приведенного выше корпуса, как с ошибками в других файлах, с другими корпусами, я не знаю.
Я понимаю, что верить надо документу UG385, но то что на официальном сайте лежит неверный документ, мягко говоря, смущает.