Подскажите возможно ли на AT90PWM3 реализовать программно интерфейс USB взятый с сайта http://obdev.com/. Конкретно интересует пример Hid-data. Можно ли обойтись малой кровью? Т.е. взять готовые библиотеки с этого примера, откомпилировать в AVRstudio+WinAVR для AT90PWM3 (конечно сконфигурировав в фаиле usbconfig.h выводы в соответствии со своим МК) и, воспользовавшись готовым ПО для ПК из этого же примера наладить связь с микроконтроллером????

Подозреваю, что можно, поскольку существуют довольно старые проекты Игоря Чешко, которые это делают, и они работают на довольно древних АВР. Написаны на асме. Я лично собирал HID. Работает. Пробовал разобраться в ПО и модифицировать под свою задачу. ПО довольно сложное, работает на пределе возможностей МК. Автор дает рекомендации по его настройке под задачи пользователя. Но в итоге я взял МК с USB на борту и не жалею. Программный USB имеет только одно преимущество - низкую стоимость, которая важна при производстве партии. Так что решать вам ...

http://www.cesko.host.sk/

Спасибо, но менять на МК со встроенным USB не хочется, поскольку большая часть программы для AT90PWM316 уже написана, осталось USB.

Сущая мелочь осталась :-) Программный USB оставит от ресурсов МК процентов 10, если не меньше. Что там останется для вашей задачи, остается только догадываться ...

Будут ли работать проекты с сайта http://obdev.com, если готовые библиотеки подключить и откомпилировать в WinAVR а затем прошить, а то везде где не встречал проекты с данного сайата, рекомендуется редактировать Make фаил.

Да, ресурсы USB сожрет по самое нехочу. Но даже если не будет работать на Вашем чипе, всегда можно взять ATTINY45, вкомпилить туда Ваш HID или USB-СОМ и соорудить интерфейс между ATTINY45 и Вашим чипом.
Так вы получите дешового и не очень шустрого посредника между USB и Вашим устройством.
Это если очень хочется. Но лучше приспособить специализированные решения типа USB-СОМ и т.д. если не хотите расставаться с Вашим чипом.

Кроме того есть большое ограничение на использование прерываний.