Варианты ответа:
1. Разработчик;
2. Отдел закупок;
3. Метрологи;
4. Заказчик :-)

Во-первых, сначала следует определить, чем вас не устраивает выходной контроль предприятия - изготовителя комплектующих.
Во, вторых, не знаю как по гостам, но по уму в первую очередь разрабатывать должен разработчик. Если разработчика нет (вы производите продукцию сторонней разработки), то те, кто отвечает за качество выходной продукции (какая-то из служб главного инженера).
Пожелания заказчика учитывать можно, но он здесь не главный: его задача принять вашу продукцию по согласованным с вами критериям качества, а как вы это качество обеспечите - ваша проблема. Исключение - военный заказчик: он диктует гораздо больше.

Разрабатывает тот кто проводит ВК, согласует заказчик.
У нас сложилась следующая практика - есть общая программа ВК, согласованная поставщиком и Заказчиком (потребителем).
Поставщик (испытательный центр) разрабатывает технологический маршрут проведения ВК для каждого элемента в соответствии с общей программой, согласуя это все с приемкой.

Порядок проведения входного контроля регламентируется ГОСТ 24297-87 (Входной контроль продукции. Основные положения). Есть еще Р 50-601-40-93 (Рекомендации. Входной контроль продукции. Основные положения).
У нас на предприятии перечень входного контроля разрабатывают конструктор и технолог, согласовывают с инженером по стандартизации и метрологом, утверждает руководитель подразделения и начальник отк (отделы, работающие с военными, и с представителем заказчика его согласовывают). Стандарт предприятия, по которому все это делается, разрабатывал вроде бы инженер по стандартизации (даже не знаю почему именно он, видимо звезды так сложились )