Недавно пришлось заниматься настройкой 10 плат, 2 слоя, размер 10х4 см, на плате установлен проц ADSP и переферия к нему. Платы новые, не эксплуатировались. На двух платах КЗ по питанию +3,3В. Кто знает эффективные способы поиска места КЗ?

Подать миллиампер 100, пощупать - не греются ли микросхемы? Подать амперчик-другой от мощного блока питания, посмотреть где дым пойдет.
Кроме шуток - насчет дыма, как-то получили плату с тончайшими перемычками между дорожками (слава ЭТАЛу), только так и нашли - выжгли. Естественно, сначала остальное всё перепробовали.

Вот только выжигать мелкие перемычки лучше не блоком питания, а мощным конденсатором. У меня был на 200000 uf - заряжаешь его до нескольких вольт и за пару подходов все ненужное отгорает
Предварительно конечно проверив как предложил HARMHARM.
P.S. Вообще-то для плат сделанных без электроконтроля (или с электроконтролем но на Украине ) следует делать проверку на КЗ по разветвленным цепям (обычно это питание) до пайки элементов. Возможно это видится перестраховкой, но это лучше чем сидеть несколько дней с лупой или микроскопом.

Какой-такой перестраховка? Нормальный входной контроль.

Есть книжка Боба Пиза - Обнаружение неисправностей в аналоговых схемах, в ней в частности приводится схема простенького пробничка, для поиска коротышей. Я делал такой, когда из китая пришла стопка плат после монтажа с черной маской, полигоном "-" на нижней стороне платы и "+" на верхней и козами между + и - на 30% плат)))) На платах при этом стояло по два циклона и куча рассыпухи.

Было дело, искал КЗ по питанию подавая от БП пару вольт через резистор, измерял милливольты на плате, только плата была большая. А тут мелкая, проводники короткие. Боб Пис свой пробник тоже для больших плат рекомендует. КЗ в итоге нашли, нашёл человек бывалый, через его руки этих плат прошло немало.