Экспортирую схемы из Протеля (File - Save As - Saved AutoCAD files ....) Вижу: Choose Document Scope: - Just this document; - All schemativ documents in this project; - All open schematics documents.
Так вот, при выборе 2-го или 3-го пунктов получаем N копий текущего документа (с разными именами). Это всегда так или у меня глюки? Протел 2004, СП4 (впрочем, и на раньших так было)

нет, файл получается в одном экземпляре, но соединений на схеме (т. бишь точек) нет и в помине.

Да, добавленные точки иногда пропадают, но файлов получаем столько, сколько заказали, но одинаковых.