При исполнении сброса по команде +CFUN=1,1 модуль SIM300Z не вызаимодействует с БС (во всяком случае версия B20). Соответственно перерегистрация не происходит. Модуль SIM900 взаимодействует с БС, выполняет начальную подготовку, которая завершается Call ready. Неясным остается вопрос, выполняет ли он при этом перерегистрацию (как при смене LA), или полное отключение/подключение к сети, или не отключившись, действует как при первичном подключении. Точнее, как бы понять учитывается этот сброс в счетчике на SIM-карте?

А документацию хоть просматривали?

SIM900_Sim300_ATC_Comparison_V1.01.pdf

For SIM900, AT+CFUN=1,1 will reset module and OK will be returned after reset. For SIM300, AT+CFUN=1,1 will not reset module.

Если модуль сбросился, то для симкарты это равносильно выключению питания, так как при сбросе питание с нее снимается.