Есть плата, на плате установлена EP1k30QI208N и конфигурационное устройство EPC2.Через некоторое время перестала загружаться конфигурацмя(все ноги плис висят в логической "1", потребление тока уменьшилось).EPC2 в норме - по jtag конфигурация заливается. Проверил ноги epc2 - припаяны.

Собственно вопрос - а в чем еще может быть проблема?

Дык ну плисина отвалилась! У Вас это первый раз?
Паяли где? Плата разведена и изготовлена с соблюдением стандартов?

В смысле отвалилась?Сам кристалл мертв или ножки отошли?

Паяли на нашем производстве на заводе Навигатор кажется.Разведена плата правильно.Высокочастотных сигналов нет(максимальная частота - 5Мгц).Кондеры по 0.1 мкф у кристала самого поставлены.

Может быть и то, и другое. Но обычно просто ноги отваливаются. Нажмите на нее пальцем (не бойтесь и надавите с хорошим усилием, чтобы почувствовалось начало изгиба) и попробуйте сконфигурировать. На рентгене посмотрите. JTAG, наверно, не поможет, эти ноги, насколько я помню, не управляются. Но могу ошибаться.
В общем, если ничего не поможет, отдавайте в ремонт и не мучайтесь.

Ну, с таким же успехом можно просто взять и пропаять все ножки, да и снова попробовать.

Да, подвело зрение акелу. Показалось, бга...