В общем плата не соответствует схеме, как привести в соответствие непонятно.

Ну вот ещё от слова SOS одну S потерял.

Генерите лог отличий, открывайте схему и правьте по списку, пока все не сойдется.

Извините за неосведомлённость - поподробней если можно.

Проблема не снята. Уточняю схема - Allegro Design Entry CIS плата - Allegro PCB Design. Кто знает откликнитесь ПЛИС.

Сделайте сравнение:

Нажмите для просмотра прикрепленного файла

По его результатам редактируйте схему, пока не получите то же, что в плате.

Да, редактировать вручную - Concept HDL не добавлеяет автоматом отсутствующие на схеме компоненты и не цепляет к ним цепи. Он умеет только делать свап и переименование. Это вам не ПКАД...