Развёл плату, частично руками, частично Specctr-ой. Стал заливать земляными полигонами верхний и нижний слои: нижний - получился нормально, а верхний - какой-то бред: что-то не залилось, а что-то наоборот - наехало. Долго мучился, перевёл в PCAD2002 - то же самое. Пробовал разные настройки в заливке, ничего не помогало. В конце концов, сделал небольшой земляной полигон на TOP-слое, стал двигать по плате и вычислять, где всё валится. Оказалось, PCAD-у не нравятся несколько проводников, которые я разводил вручную. Убрал их, переразвёл опять вручную в сетке покрупнее... Всё! Заливка пошла! Как достали эти глюки последних Пикадов .
Версия PCAD2004SP3 Build 18.03.4485. Кому интересно, в файле плата с глючным полигоном. Проводники, которые пришлось переразводить называются OUT1 ... OUT5 и их инверсия.