А что можно сказать про эту схему?

Здесь помоему от фотодиода не чего так уж сильно и не зависит. Можно учитывать чувствительность, ёмкость перехода, время нарастания, затухания(последние 2 в данном случае очень важны) фотодиода.

Всё в этом варианте схемы хорошо, но вот только этими двумя резисторами и можно будет настроить усилитель(изменение всего остального затронет работу каждого фотодиода равным образом, а значит толку не будет). А это есть всего одна степень свободы. Боюсь, что настроить "хорошо" усилитель не удастся. А в случае с двумя усилителями этой проблемы не будет.

Вот такие противоречия, весь выбор за проектировщиком устройства.

А какие ещё параметры усилителя, кроме Ку, Вы собираетесь настраивать?
Почему? Не понимаю, хоть убейте.
Если Вы не хотите умножать число сущностей, и готовы ждать 0,5 секунды установления компенсирующей цепи, чтобы по его окончании провести измерение, доработка схемы, предложенная мной, вполне уместна.
В противном случае, нужно дублировать почти всю схему, за исключением тактового генератора и цепи светодиода.
Я бы на Вашем месте рассмотрел возможность применения МК с АЦП на борту для решения подобной задачи - получится дешевле и надёжнее. Если это интересно - можно обсудить.

Именно Ку и собираюсь настраивать, да и только.
А вот обеспечит ли настройка одним резистором, конечно в паре с подстроечником, требуемую точность задания Ку, есть сомнения.

Ну а использование МК с АЦП - здесь вопрос не стоит. Не на стрелочный же прибор выводить результат. В моём устройстве есть МК С АЦП(встроенным).

Но как я понимаю, Вы хотите возложить бремя "точности" с Ку усилителя на МК. Или я ошибаюсь?

Возможно ли Это в данном случае, и главное с какой точностью?

Закрадывается мысль, что можно будет использовать какие-то поправочные коэфф. при расчёте фототока Микроконтроллером.

А как ещё это можно сделать в аналоговой схеме?

Да, об этом и речь.

Нет, так не пойдёт. Требуемую точность от Вас как раз хотелось бы получить...

Всё то, что делается в аналоге, в данном случае реализуемо программно.

Но это я думаю только разрядностью АЦП можно достичь.

Имеется в виду, что желаемая точность должна быть Вам известна. Вы же прикидывали свои требования к результатам? Если нет, начните с этого.

МК со встроенным АЦП уже давно выбран, это ATMega8L. Так что здесь проблем нет. Даже подсчитано, что этой разрядности вполне лостаточно.

Нет, формула в первом приближении (при небольших плотностях тока через кристалл) верна для любого знака смещения. В данной схеме фотодиод включен в генераторном режиме при нулевом смещении, и работает он на КЗ. При использовании режима проводимости (с обратным смещением) и при сохранении КЗ по входу усилителя ничего принципиально не изменится.
Конечно. Наличие отрицательного смещения лишь уменьшает барьерную ёмкость p-n перехода, в данном случае несущественную.

Тогда попытайтесь реализовать цепи компенсации темнового тока программно. В качестве выходов компенсаторов можно использовать ЦАПы на ШИМ, реализуемые с помощью таймера T/C1 меги. Точность измерения от этого только выиграет.
Вообще-то, вместо ATmega8 я бы посоветовал использовать более новую ATmega48.