Вычитал в даташите на мегу 16 в ней есть RTC как я понял это часы реального времени.
Как использовать в CVAVR этот девайс?

Читай апнот AVR134 и делай по аналогии

Подключить часовой кварц к TOSC1/TOSC2, корпус кварца заземлить, и читать раздел даташита "Asynchronous Operation of the Timer/Counter"

Ясно... я надеялся он внутренний

У внутренней RC-цепочки очень плохо со стабильностью частоты, так что тут все грамотно сделано.

А где в меге 16 часы реального времени, это из нее сделать можно часы реального времени, если кварц к ней прицепить, а лучше повесить внешнюю микросхему что-нибудь вроде DS1307 в CodeVision есть библитеки для работы с ней, нормально работают

Из даташита, первая страница

Т.е. С-это не Clock, а Counter, т.е. счетчик.
А на основе этого счетчика реализовать функцию часов труда не составит.

И стОит почти столько же, сколько та же мега16.
Хотя, если цена не критична и питать в стендбае нужно только часы, то это действительно лучший вариант.

Хммм....
Нашел кварц на 32786 Гц, но это не резонатор? Т.е. нужно еще конденсаторы подключать?

Выглядит как маленькая трубочка из метал. корпуса с двумя выводами.

не нужно.

Оно и есть, конденсаторов не надо.

Там где оно щас стоит подключено только двумя выводами а корпус висит в воздухе...
Стоит в бывших часах-дисплее от телефона...

Если точность хода и надежность запуска RTC не важна, то можете не подключать.
В противном случае почитайте хотя бы, например, этот документ Crystal Considerations with Dallas Real-Time Clock.

И не забудьте смыть флюс после пайки.

Не попедалась на глаза микросхема типа DS1307( с вычислением весокосных лет, внутренним ОЗУ, полным годом), только ещё с будильниками, таймерами и выходом прерываний?