Тут еще дело в том, что отчет синплифая показывает совершенно отфонарные цифры, никак не коррелирующие с отчетом STA после PAR. Они могут отличаться в два-два-с-половиной раза, причем как в сторону замедления, так и в сторону убыстрения.

после чтения ветки комментов я сделал вывод что это после PAR
Прочитал еще раз. Вы правы, после синтеза. Подожду когда в той теме опубликуют отчеты после PAR

Может быть дело ещё в том, что это Speedster22i HD, а picoPIPE в Speedster22i HP.

и про НР уже давно не слышно

об чем и речь, гора родила мышь (с). Вместо прорывной ПЛИС, вышла типовая плис, которая берет технологией (по факту брутфорсом). Та же альтера, когда оседлает интеловские 14 нан, сделает плис на те же частоты, которая архитектурно на голову выше HD.