Библиотека тут не причем, а длина выводов тем более.
Важно положение их на схеме.
На в данном случае и это не то.
Так как Netlabel лежит на линии связи.
Вот координаты первого и линии связи и нужно смотреть

Вроде везде все в сетке.

Я уже пробовал удалять и вставлять заново и NetLabel и Wire и УГО неоднократно.
Почему-то не помогает.

Попробуйте перемещать Netlabel просто или с зажатым CTRL
Если линия связи тянется в месте с ним, хотя бы в одном режиме-- значит привязаны друг к другу.
Если нет-- надо искать дальше

Выложите часть схемы с проблемой

Если нажать Ctrl и тянуть за NetLabel, то тянется один NetLabel.
Если тянуть за NetLabel без Ctrl, то NetLabel тянется вместе с Wire, отцепившись при этом от ноги микросхемы.
 DupTester.rar ( 20.88 килобайт ) Кол-во скачиваний: 15

У вас все стоит не в сетке.
Главная причина микросхема.
Там выводы не в сетке стоят.
После того вы рисуете линии -- и они соответсвено привязываются и попадают не всетку. После них ставите netLabel и также они привязувыются к линиям, которые не в сетке.

1. Конечно нужно править в библиотеке но можно и тут.
2 в свойствах микросхемы снимите Lock pin
3 выделите все и aLign to Grid
4 Выделите только Pin и aLign to Grid

После этого сотня ошибок пропадет
скопируйте и сохраните исправленный УГО в библиотеке.

Не используйте чужие заготовки для своих библиотек, возможно они делались в миллиметровой сетке

у вас какая то проблема с первым выводом.
если подвигать микросхему, что видно, что она цепляется либо за 1 вывод либо за все остальные кроме первого (видно по появляющимся красным крестикам, сигнализирующих о подключении)
склоняюсь к тому, что библиотека была импортирована.
или вообще весь кусок схемы

Именно так.
Если сделать проверку выполнив только третий пункт, на первой ноге появляется точка Dot. Это означает что вывод первой ноги лежит несколько "левее" остальных.

Вот накой АД сделал варианты сетки в схемном редакторе? Путать людей? Или это была вынужденная мера, когда люди портируют свои библиотеки с PCADа (или прочих САПР)?

Я уж лет 10 об этом талдычу.
Была б одна единица DXP default -- тут бы треть сообщений исчезла

импорт тут не причем. Это было до поглощения PCAD

Вроде Align to Grid помогло.
Но все равно я не понял, почему у всех пинов, и у всех компонентов, которые были не в сетке, были круглые координаты, как будто бы они в сетке.

Вы правильно заметили -- круглые. все, что после запятой не отабражено, но это не означает, что там ноль. Вариант 1500,0234 вам отображается как
1500

А как посмотреть реальные координаты, а не округленные ?
Насколько я понял, в режиме сетки Dxp Defaults, округляется до целых.
А в режиме сетки Mils, округляется до 3го знака после запятой.
Правильно ?

Можно талдычить сколь угодно, но все программы покупают директора и менеджеры, а не инженеры.
А у директора один вопрос: а можно ли у вас работать в миллиметрах? нет? ну до свидания.

милиметры хотябы соответствуют международным стандартам, в отличие от устаревших дюймов.

Каким именно стандартам? Бумажным или фактическим? Де-факто весь мир рисует в дюймах и его производных и не парится. Вы хоть какой-нибудь референс схематика видели в миллиметрах нарисованным?