А что мешает изменить схему как надо ?
Если хотите отключать батарейку - поставьте mosfet, хотя надо посмотреть на Iq у этого TPS. У TI есть преобзователи с 500nA Iq, что примерно то же что и с mosfet - только деталей меньше. Отключать от процессора вообще не проблема.

Хотя можно уложиться в 5-10uA и при включенном процессоре.

Подскажите?

Не понял, что именно.
Как сделать схему ИЛИ ?

Всегда тоже так считал. Но уже прорву мышек встречал, где именно так и сделано. Даже удивляюсь: вроде последовательным соединением можно было бы решить больше проблем. Тем более, что отработанные всё равно выбрасывать. Так почему же "не есть гуд"?

Соединяю Ли- батареи впараллель более 12-ти лет для серийной аппаратуры (примерно полсотни заказчиков) и без отдельной зарядки каждой ячейки, только полной батареи с балансировкой при последовательном соединении ячеек. Конкретно, покупаем Ли- батареи с конфигурацией 4х-впараллель+3х таких последовательно (номинал 10.8В), и также 3х - впараллель (номинал 3.6В), как законченные пакеты. Проблем из-за таких конфигураций не имел.

Схему конечно

Уменьшить 5 ампер, которыми сейчас с оставшихся шести попыток контакты-задохлик SB1 пытаются зарядить C12, до 1,5 мА, вставив между ними резистор 1 кОм, а C12 уменьшить до 10 нФ и через резистор 470 кОм подать на него подхватывающий сигнал с выхода микроконтроллера.

спасибо.

И через резистор в 470кОм как подзарядить конденсатор, так его и разряжать?
А как можно при напряжении в примерно 0.8В на батарейке реализовать ее отключение от регулятора и подключении к нему при нажатии на кнопку?

Непонятно, почему Вам лениво потыкать в калькулятор, но на C12 может быть не более 1,5 В.

Также непонятна настолько моментальная забывчивость — ведь при наличии никем не отменённого R11, для выключения микроконтроллеру достаточно перевести порт обратно в третье состояние.

Ну а вусмерть дохлый элемент — уже при 1,3 В, в чём элементарно убедиться, вынув его из типового пульта ДУ.

Я понимаю что на C12 будет не более 1,5В.
Для выключения контроллеру перевести ногу в лог '0', дабы максимально быстро разрядить С12.
С напряжением 0.8 маху конечно дал. Конвертер работает от 0.9В, т.е. я надеялся разрядить батарейку до максимум возможного.
Отсюда и вопрос: можно ли организовать схему отключения батарейки от нагрузки после харакири МК и ее подключение по нажатию кнопки? полевой транзистор, как я понимаю, при таком напряжении уже не поможет.

При выключенном преобразователе на его выходе ноль, а сам он потребляет 1 мкА — какое Вам ещё требуется отключение?

25 uA судя по DS в shutdown
Я использую TPS61098X c 300nA Iq

Читайте паспорт внимательнее — I_SD типовой 100 нА, максимальный 1 мкА.