А вообще, очередная версия MPLab-а у Мелкочипсов выходит примерно каждый месяц. В каждой что-то добавляют. Вон, недавно "code folding" сделали. Но вместе с фичами естественно добавляют и глюки

. Так что у них есть "стабильные" версии, оканчивающиеся на "0", и "беты".
Что выбрать - вопрос личных предпочтений