В CVAVR был с помощью CodeWizardAVR проект, в котором по таймеру менялось значение одного из портов. Практически без изменений этот же проект был перенесен в IAR. При тестировании в AVRStudio4 обе программы вели себя полностью одинаково и корректно. Однако в микроконтроллере корректно работала только программа, написанная в CVAVR. В IAR программа выполнялась, но без вызова прерывания. Контроллер прошивался в обоих случаях через CVAVR STK200. Поскольку в симуляторе обе программы работали корректно, то ошибка скорее всего возникает при создании hex файла. Формат вывода выставлен как Intel standart.
В чем может быть проблема и какие настройки надо изменить, чтобы все работало нормально?