МК: ATmega16l.
Напряжение питание: 3.3 В.
Программатор: JTAGICE mk2(ISP mode).
IDE: AVRstudio 4.17 666

Не провести программирование и установить fuse биты. При первом чтении сигнатур или fuse битов все отображаеться корректно, но при последующих манипуляциях( обновить сигнатуры или считать fuse) -- сигнатура неверная, fuse сбрасываються в 0( установка всех возможных галочек). Если не отключая питания перезапустить программу для прошивки МК, то ситуация повторяеться. Erase провести можно. Проявляеться на 3 платах из 6. 3 работают и прошиваються корректно.

в чем беда ?