1. А оно вообще компилировалось?
2. Может подхватился другой makefile?
3. Проверьте дальше в makefile наличие строчек
Код
FLAGS = -mcpu=$(MCU) -mthumb
...
AFLAGS = $(FLAGS)
...
CFLAGS = $(FLAGS)
CFLAGS += $(OPTIMIZE)
...
CXXFLAGS = $(FLAGS)
CXXFLAGS += $(OPTIMIZE)
Если бы я знал, что такое электричество...