Если импульсы - это просто трапеции, то можно легко обойтись средствами CST DS, просто создайте свою модель в MWS, а потом откройте в DS и появится возможность задать в качестве входного сигнала для Transient Simulation Task последовательность импульсов, параметры которых (фронты, длительность, последовательность бит и т.д.) можно задать в диалоговом окне. Как в
примере на сайте CST.