У меня R2010b, возможно они поменяли с того времени набор функций из fi тулбокса. fi_radix2twiddles и fi_m_radix2fft_withscaling не входят в состав стандартных функций (на них даже хелпа нет), я их вытащил из
примера. Вставил в свой скрипт, он их откуда-то из своих недр добыл. Собственно в примере есть их исходники.