Keepout нужен только самому АД и только для автораута. Для изготовления плат он не нужен. Если контур платы задан _только_ в нем, то это не совсем хорошо (последовательность слов можно поменять по вкусу

).
По умолчанию предполагается, что контур платы задан в Mechanical1, и опять же по умолчанию этот слой включается во все герберы.
Имеет смысл уточнить у производителя, есть ли ограничения на формат герберов (imperial/metric, точность, leading/trailing zeroes, ...) и на используемые примитивы (в первую очередь - полигоны и текст).