могу поделится опытом, было давно и не правдо

, однако когда только начинал осваивать МК - пытался связываться к компом по RS232, c JTAG эмулятором всё отлично работало, а как только его отключал - переставала работать связь с PC... оказалось - не было земли

, а при подключённом JTAG, земля проходила через него.... Глупейшая конечно ошибка, но "опыт - сын ошибок трудных...."
Может у Вас проблема из этого разряда? Электроника - наука о контактах.