Попробую ответить в меру своих поверхностных знаний:
Цитата(UniBomb @ Jul 17 2007, 17:22)

- Все ли контроллеры имеют одну и ту же систему команд? Т.е. например и у филиппса и у атмела есть камни на ядре ARM7TDMI, значит ли это, что они используют оду и ту же мнемонику?
Они совместимы снизу вверх, т.е. код для ARM7 идет на ARM9, от ARM9 на ARM10, ARM11 и т.д. В ARM9 добавлена команда CLZ по сравнению с ARM7, может еще какие-то. Между собой все ARM7 имеют одинаковую систему команд. Но кристаллы от разных производителей имеют совершенно разную периферию (и соответственно разные имена SFR и приемы работы с периферией) вплоть до контроллера прерываний.
Цитата(UniBomb @ Jul 17 2007, 17:22)

- Какая разница - синтезируемое ядро или нет? (и что это такое?)
Какая-то разница есть. Слышал, что у синтезируемого ядра на такт отличается время входа в прерывание (в какую сторону - не помню). Думаю, что на реальных задачах заморачивать себе голову этим вопросом не стоит.
Цитата(UniBomb @ Jul 17 2007, 17:22)

- Я так понял что эти камни могут работать как из под ОСи, так и без неё. В таком случает что из себя представляет просто программа? Для каких задач нужна ОСь?
Да и AVR могут работать из-под ОСи, и примеров таких много - FreeRTOS, Ethernut, scmRTOS и т.д. "просто программа" представляет из себя то же самое что и на AVR - бесконечный цикл в main(). "Программа под ОСью - вызов функции старта OS в main() и по бесконечному циклу в нескольких потоках. Что касается нужности ОСи - "настоящие программисты пишут на фортране на любом языке". Если у вас когда-нибудь, пока программа крутится в цикле чего-либо ожидая, возникало желание в это время заставить программу сделать что-то еще - ОСь бы помогла сделать это легко и естественно - как только один поток захотел чего-то подождать - управление автоматически передается другим потокам. Или если у вас возникнет желание разделить программу на две "нити", которые выполняются параллельно - например одна измеряет и крутит моторы-клапана, а вторая через последовательный порт отвечает на запросы оператора - самое время почитать что-нибудь про ОСь.