Здравствуйте, можно и я свои 5 копеек брошу

Для каждой платы действительно все индивидуально.
Я, например, сначала ставлю разъемы, индикаторы и всякую прочую лабуду, котора завязана на корпус прибора.
Потом примерно делю платку на функциональные зоны (преобразователи напряжения, входные усилители, цифровая часть, выходные каскады),
а потом уже туда пытаюсь впихнуть деталюшки

.
Почему-то мне кажется, что кондеры по питанию имеет смысл ставить непосредственно под микросхемой (с обратной стороны платы), а остальную рассыпуху все-таки лучше по возможности пытаться впихнуть на верх (пи настройке геморроя меньше, не надо слишком часто плату туда-сюда вертеть), да и "земли" с обратной стороны больше будет.
И есть такая вот прикольная статейка, мжет кому и пригодится:http://www.analog.com.ru/Public/10.pdf
Удачи