Спасибо за ответы. Старшие товарищи на месте подсказали

) В конвертируемом схематике поменял у элементов футпринты(в свойствах) на те, в которые хотел конвертить альтиум, помогло, только 2 микросхемы не признали футпринты. Тогда создал библиотеку писиби и в ней уже переименовал имеющийся футпринт на требуемый схематиком. Вроде все засинхрилось. Всем спасибо