вообще-то WinAVR - это сборка GCC под Win, AVR-Libc к этому отношения не имеет, поэтому на счет поддержки UNICODE обратитесь к документации на GCC - ведь как-то работают другие программы с UNICODE

...
есть там параметры -fexec-charset, -fwide-exec-charset, -finput-charset.