Не совсем понял ситуацию
Цитата
при подаче напряжения прграммирования на "подопытную" микросхему, в случае, если она неисправна, это напряжение попадает на управляющий МК
Имеется в виду, что какой-то из входов программируемого контроллера может быть пробит на землю? Если так, то для этого ставятся буфера (заодно служащие для адаптации логических уровней) и ограничительные резисторы.
Цитата
Но есть же микросхемы и без ИД. Как быть в этом случае? Хочется услышать решение без использования разных джамперов, переходных колодок.
Порядок действия "разъясняется" управляющему контроллеру верхней программой с компа.