Вы решили, что на этом форуме другие люди?

А вот и нет...
По вопросу: все реально и так всегда и происходит. Можно делать плату, внося при этом изменения в схему. Вот только нэтлист после этого генерить не нужно. Для внесения изменений предназначен механизм ЕСО(engeneering change order). Включается вроде бы в меню Options, хотя тут не уверен, посмотрите сами где он включается.
С помощью ЕСО(только когда он включен!) изменения происходят след. образом: при сохранении схемы прога спрашивает разрешения на запись изменений в ЕСО-файл. Вы соглашаетесь - файл записывается. Потом переключаетесь в РСВ и делаете импорт изменений(Utils - Import ECO) - записанные изменения вносятся в плату. И все, никаких нетлистов. Разве что для проверки соответствия схема-плата можете его использовать(Utils - Compare Netlist).
PS Да, на всякий случай, изменения в РСВ точно таким же образом переносятся в схему.