Мы уже года три пытаемся переползти на SMD (почти все остальное на платах уже SMD). Но каждый раз при разработке новой платы получаем отлуп от снабженцев/логистиков - "SMD электролиты сильно дороже, чем выводные даже при ручном монтаже".
Как уже верно было замечено - подавляющее большинство современных копьютерных плат использует выводные электролиты. Вот как континентальные азияты перейдут (и если перейдут) на SMD, то и цена упадет. А то действительно - выводной монтаж достал уже - один геморрой

.
Если у Вас на плате все остальное SMD, и снабженцы не возражают, то конечно, лучше применить SMD электролиты. Вас потом на производстве за это похвалят