Отпишусь не с целью поспорить с Сергеем, а просто изложить чуть другое мнение

Библиотека не должна рисоваться "под схему". Схема завтра будет другая, а символ перерисовывать - тратить время, вносить дополнительные ошибки...
Чаще всего порты располагают именно так - одной большой "кучей", рисуют шину и направляют их все сразу туда. А из шины их можно "доставать" по мере надобности в нужных местах.
Пины питания, кварц красивее расположить снизу. Тогда вспомогательная обвязка не будет мешаться. Рисуют как один пин питания, так и сразу много - разницы никакой, на мой взгляд.
Конденсаторы фильтрующие... Ну, я (и не только я

) рисую просто гирлянду конденсаторов, а потом развешиваю их на необходимые ноги. Проблем больших тут нету.
Хотя лучше будет поместить рядом Vcc + Gnd, AVcc+ARef+AGnd - чтобы конденсаторы ставить прямо между ними.
Ещё проблема с pattern'ом - никак не обозначена первая нога. Если уж делать шелкографию, какой-нибудь кружок между 1-й и 44-й ногой стоит предусмотреть.