Можно и так.
1. Ни каких дополнительных и лишних слоев
2. Располагаем одни полигон на слое
3. Place/line. устанавливаем нужную ширину и свойство KeepOut
4. Делим наш полигон на куски как нужно, таская линию за узел
5. Делаем полигону Explode и присваиваем частям нужную Net
Все довольны