Добрый день!
Позвольте пару советов, вернее мыслей по работе вашей будущей сигнализации:
1. Сигнализация - это довольно критический компонент для автомобиля. Соответственно и работать должен максимально надежно.
2. Телефон может разрядиться или заглючить в самый неподходящий момент.
3. Представьте ситуацию - вы подходите с девушкой к машине, и начинаете куда-то звонить с телефона, чтобы машина открылась. Выглядит жутко

Мое нескромное ХО: телефон надо рассматривать как средство оповещения и _аварийного_ управления сигнализацией. Основное управление должно идти с брелока. А если в машине уже есть центральный замок - тогда сигналка ставится slave-системой и работает от него.
Одно время тоже хотел сделать сигналку, но когда оценил затраты времени - понял, что дешевле и лучше купить. Если есть желание пообщаться на эту тему - пишите на ящик krdmitry84 гав gmail точка com