Если не зацикливаться на Атмеле, то MPC82G516 - самое то оказался (отдельное спасибо
Step_ARM за созданную здесь тему

). Но бутлоадер в него таки надо прошивать фирменным программатором за $50, тот, что зашит изначально - не под COM-порт (или так повезло с партией). Ну, то ж один раз делается, а обновления - уже через COM-порт.
Ещё на NXP (P89LPC9xxx) можно взглянуть. Чуть дороже, и для ISP "примочка" небольшая требуется. 1 шт. 74HC02 и несколько резисторов.