Согласно даташиту на ваш контроллер:
P2[10]/EINT0
76[6]
Note: LOW on this pin while RESET is LOW forces on-chip boot-loader to take over
control of the part after a reset.
Если в LPC2388 нет USB bootloader-a как в LPC1343, то просто замыкаете на землю P2[10] (76pin) и также RESET, после чего отпускаете RESET через подтяжку.
Если есть, то по аналогии с LPC1343 могу предположить, вывод USBVBUS нужно посадить на землю, иначе bootloader будет работать с USB.
Не знаю насколько это вам поможет, но в схеме
LPC1343 Code Base слева вверху есть простой способ подключения кнопки для старта bootloader-a, и чуть ниже с делителя подается напряжение на USBVBUS, который уже сигнализирует о необходимости запуска USB-bootloader-a при подключении к USB.
Bootloader вероятнее всего висит на UART0.