Самое простое это выводить гербер(manufacture -> artwork), а затем его печатать.
Plot печатает так как вы видите на экране. Настройки - plot setup. Чтобы было видно дырки: setup -> design parameter вкладка display, расставляете галки и вуаля! Еще нужно убрать прозрачность: display -> color\visibility в окошке выбираете display, выкручиваете ползунки на 100%. Как видите, проще сделать гербер