Пока что из форума Cadence удалось получить такой ответ:
Цитата
Currently the Custom Layers in the Padstack are not configurable as mirrored, this is likely to be an enhancement to be implemented in an upcoming release. In the meantime, you might want to use the "filmmask" entries, it's unlikely that you will be using these for any other purpose. When you generate the artwork, add the relevant PIN/FILMMASK_TOP (Bottom) to the Assembly output.
А для чего вообще придуманы слои filmmask*? Кто-нибудь с ними работал? Они переворачиваются правильно...