А какие у вас есть приборы вообще. Если есть цифровой осциллограф с функцией запоминания, то на некоторых можно запомнить сигнал на флеху или по сети.
Если полоса пропускания позволяет, то можно использовать встроенную звуковую карту.
В реальном времени можно снимать в Матлабовский файл, в текстовый файл с помощью АЦП с компьютерным интерфейсом.
Когда-то мы такое делали. И не только мы. (Но это дорого)
В Matlab можно организовать обработку "на пролете". Посмотрите их
Acquisition toolbox. Там есть пример построения мех-файла для собственного устройства. Это долго, но учитывая, что сейчас конец сентября, а не начало июня, вполне можно успеть.
Некоторые фирмы предоставляют готовые библиотеки для использования с Matlab и LabView. Поищите в интернете.
А вообще нужно знать какое количество каналов необходимо оцифровывать, какова полоса спектра сигнала, на какой частоте, размах сигнала по амплитуде, длина пачки по времени, скважность между импульсами и ...