Не стоит забывать и про разброс IBIS моделей (low,std,high). Еще имеются допуска на толщину ПП. Да и с диэл. проницаемостью тоже не все гладко.
Из этого всего можно сделать вывод: весь этот SI анализ носит крайне рекоммендательный характер.
Парадокс заключается в том, с SI или без него, все равно Вы свою плату отладите, вопрос в количестве нецензурной брани генерируемой разработчиком

Еще не стоит забывать про "земли". Особенно на двухслойках, выбросы, образованные на паразитной индуктивности, в несколько раз могут превышать выбросы интерференции отраженных волн.
В качестве пищи для размышлений, увеличение ширины проводника в 10 раз уменьшает паразитную индуктивность в 2 раза.