Могу ли я сложную принципиальную схему разбить на функциональные части (функциональные группы), каждую часть я рисую на отдельном листе схемы?
На первом листе я эти части изображаю в виде функциональных групп и соедииняю между собой.
Нормоконтроль говорит что так делать с неповторяющимися частями нельзя, можно так оформлять только те группы, которые повторяются на схеме.
К группе #3-#6 у них притензий нету, а вот #1-#2 им не нравится, так как они не повторяются.
Нажмите для просмотра прикрепленного файла

Из вашей схемы мне не понятно что из себя представляет #2. Т.к. в неё входит только одна цепь, а должно быть как минимум две

Не обязательно что их должно быть две, единственное что сигнал со второй группы надо было нарисовать справа, он исходящий.
Вот листы блоков #1 и #2. Схема на блоки #3-#6 выполнены в виде самостоятельных схем.
Нажмите для просмотра прикрепленного файла
Нажмите для просмотра прикрепленного файла

Вам ничто и никто не мешает нарисовать на принципиальной схеме "каждую часть на отдельном листе".
А вот функциональную схему надо оформлять как самостоятельную схему. И опять же никто не мешает вам сделать её первым листом в файле проекта.
Вам только надо разобраться, как вы будете обозначать элементы на функциональной схеме, что бы по обозначению можно было понять куда смотреть.
ГОСТ 2.701 и 2.702 вам в помощь, раз ваш нормоконтроль не может вам предложить варианты оформления...

Так оно так и сделано, каждая часть на отдельном листе, на первом листе соединяю их. Они говорят что нельзя так делать, так как функциональные части не повторяются...

Функциональные группы и функциональная схема - разные вещи. Читайте ГОСТ 2.701 и 2.702.

Читал, мне функциональная схема не нужна, я хочу на принципиальной объединить листы через функциональные группы. Вопрос в том что нормоконтроль разрешает повторяющиеся части схем объединять через функциональные группы а если не повторяется то не разрешает.

Для этого функциональные группы и нужны. А когда они не повторяются, то их уже нельзя называть функциональной группой (в терминологии ГОСТа).
Чем вас не устраивает вариант оформлять "прямоугольниками ваших групп" структурную или функциональную схему?

"Функциональная группа - совокупность элементов, выполняющих в объекте определенную функцию и не объединенных в единую конструкцию.
Функциональная часть - элемент, устройство или функциональная группа, имеющая в объекте строго определенное функциональное назначение. "

Вот я схему и разбил на части, одна за питание отвечает, другая за конфигурацию.
Повторюсь, структурная или функциональная мне не нежна, нужна только принципиальная, по которой я делаю печатную плату.
У меня спор с нормоконтролем, они говорят что на принципиальной схеме нельзя изображать квадратиками не повторяющиеся функциональные группы (у которых схемы на отдельных листах) а можно только которые повторяются.

Я операюсь вот на это: ГОСТ 2.702-75
3. ПРАВИЛА ВЫПОЛНЕНИЯ ПРИНЦИПИАЛЬНЫХ СХЕМ
3.22. На схеме изделия, в состав которого входят функциональные группы, позиционные
обозначения элементам присваивают по правилам, установленным в пп. 3.17—3.19, при этом
вначале присваивают позиционные обозначения элементам, не входящим в функциональные
группы, и затем элементам, входящим в функциональные группы.
При наличии в изделии нескольких одинаковых функциональных групп позиционные
обозначения элементов, присвоенные в одной из этих групп, следует повторять во всех
последующих группах.

Тут требование для просто функциональных групп и для повторяющихся

Всё правильно. Обозначать можете. Изображать 2 раза в одном документе одно и тоже не можете.
Что бы нарисовать не повторяющийся квадратик, Вам надо оформлять группу в самостоятельную схему.
IMHO, чем заниматься исскуственным размножением сущностей, проще обозвать лист с квадратиками структурной или функциональной схемой и соответственно его оформить.

Тоесть у меня сейчас всё сделано правильно (схема в топиках выше)?

Нет.
На схеме не обозначены функциональные группы на листе 2 и листе 3. Если их обозначения "#1" и "#2", то одни и те же группы изображены 2 раза.
Первый и последующие листы выполнены по форме первого листа. И пр. мелочи оформления.


Схема не "разбивается" на части. Схему можно только разделить на несколько схем. (несколько самостоятельных конструкторских документов)

То есть надо было либо на #1, #2 выпускать отдельную схему со своим перечнем, с номером как у основной схемы но с индексом Э3.1 и Э3.2, либо выкидывать #1, #2 c первого листа и связи делать через переход с листа на лист?

Да.
Только на счёт индексов Э3.1 и Э3.2 вы погорячились. Буква "Э" - обозначает что это электрическая схема, а цифра "3" - принципиальная (полная) (читайте ГОСТ 2.701 раздел Виды и типы схем).
А номер документа пишется перед этими индексами, вот его и надо менять. Ну или читайте СТП вашего предприятия, если у вас придумали другую схему.

PS Линии связи можно объединить в линию групповой связи, а её уже таскать с листа на лист, IMHO, так удобнее.

PPS Если вы вместо оформления каждой вашей функциональной группы в самостоятельную схему (с сопутствующим набором "макулатуры") оформите один лист структурной схемы, то упростите жизнь всем тем, кто потом будет пользоваться вашей схемой.

В ГОСТ 2.701-2008 "Схемы. Виды и типы. Общие требования к выполнению" пишуть: